巴拿马公司审计报税是根据巴拿马公司管理条例规定，巴拿马公司成立后，无论是否要纳税，每年都必须报税。就算是一家没有营运的公司，也是需要提交报税表，税务局会根据报税表来评定公司是否需要缴税。

巴拿马采用属地主义之课税方式，公司只要在巴拿马当地没有任何营业行为，不管公司每年实际有多少利润盈余，当地政府皆不会再加以课征任何税。即使在当地设立办公室，操盘全世界财务运作，例如L/C、T/T只要牵涉到国外，不含巴拿马境内之利润，亦无需课税，故而吸引很多国际企业在此设立境外公司，用以收款并负责营收、开立发票之事宜。

在巴拿马经营业务的公司须缴付应评税收入百分之三十至五十的税款。在中美洲和南美洲营业的公司获科郎自由贸易区提供多项优惠，而在科隆自由贸易区经营业务的公司亦可按较低税率缴税。

在巴拿马以外地方营业的公司勿须纳税，只要缴付数目不多的年度特许经营税便可，勿须就海外赚取的收入纳税。公司逾期交税须缴交附加费。