注册澳门公司和香港公司的区别如下：

法律体系不同：澳门公司和香港公司所遵循的法律体系不同。澳门公司所受法律管制与香港公司有所不同，澳门实行的是澳门法律，而香港实行的是香港法律。

税务制度不同：澳门公司和香港公司的税务制度也不同。澳门公司需要向澳门财政局申报财务报表并缴纳税款，而香港公司则需要向香港政府申报财务报表并缴纳税款。

经营范围不同：澳门公司和香港公司的经营范围也不同。澳门公司可以从事与其宗旨相符的活动，而香港公司在经营范围上有更多的自由度。

股东限制不同：澳门公司和香港公司的股东限制也不同。澳门公司的股东数量没有上限，而香港公司的股东必须符合一定的资格要求，如必须是香港居民，且持有股份的比例必须在一定范围内。

秘密法庭不同：澳门公司和香港公司的秘密法庭也不同。澳门公司的秘密法庭只能由股东组成，而香港公司的秘密法庭可以由股东、董事、**管理人员等组成。

监管机构不同：澳门公司和香港公司的监管机构也不同。澳门公司的监管机构是澳门财政局，而香港公司的监管机构是香港政府。

总的来说，澳门公司和香港公司在法律体系、税务制度、经营范围、股东限制、秘密法庭和监管机构等方面都有所不同。选择注册哪个地区的公司，需要根据公司的实际需求和注册地区的相关规定来决定。